Детекция ДНК каприпоксвирусов методом петлевой изометрической амплификации на основе участка гена p32/ld121

Abstract

Нодулярный дерматит крупного рогатого скота – это трансмиссивное заболевание КРС (Bos indicus та B. Taurus) и азиатских водных буйволов (Bubalus bubalis), которое отнесено Международным эпизоотическим бюро (МЕБ) к категории болезней, которые подлежат обязательному сообщению. Вирус нодулярного дерматита КРС относится к семейству Poxviridae. Семейство Poxviridae можно разделить на 2 подсемейства: Chordopoxviridae, которые поражают позвоночных, и Entopoxviridae, которые поражают насекомых. Возбудитель нодулярного дерматита относится к подсемейству Chordopoxviridae, род Capripoxvirus, к которому также относится возбудитель вируса оспы овец и коз [1, 2]. Геномы вирусов оспы коз и овец очень схожи с геномом вируса нодулярного дерматита КРС. Они имеют около 97% нуклеотидной идентичности. Все гены вирусов оспы овец и коз содержатся в вирусе нодулярного дерматита КРС. Работа выполнена с использованием биоинформативных и молекулярно-генетических методов исследований. Нами разработана методика детекции ДНК каприпоксвирусов методом петлевой зотермической амплификации участка генов p32 / ld121 в условиях 30-40-мин. амплификации при 600С. Разработанная методика чувствительна (аналитическая чувствительность соответствует активности вируса 2 lg ТЦД50/мл), специфическая и воспроизводимая, а разработанные праймеры не гибридизируются с гетерологичными ДНК-матрицами.