Исследование разнообразия грибковых микроорганизмов кишечника свиней с различной конверсией корма

Abstract

В работе представлены результаты исследования высокопроизводительного секвенирования грибного микробиома кишечника свиней, а также оценка влияния показателя конверсии корма на биоразнообразие грибного сообщества кишечника животных. Биоинформатический анализ нуклеотидных последовательностей выявил в кишечнике свиней 3 бактериальных типа, в число которых вошли Ascomycota, Basidiomycota и Microsporidia. Доминирующими типами оказались Ascomycota и Basidiomycota. Наиболее многочисленными грибами на уровне семейства оказались представители Schizosaccharomycetaceae. Самым многочисленным видом в кишечном микробиоме свиней оказался Schizosaccharomyces pombe (относительное содержание для двух исследуемых групп составило 9,24±1,49). На втором месте по распространенности был вид Colletotrichum higginsianum (относительное содержание для группы А – 5,44±0,98, для группы Б – 5,97±0,76) и Thermothielavioides terrestris (относительное содержание для группы А – 3,96±0,67, для группы Б – 4,37±0,46). Сравнительный биоинформатический анализ кишечного микобиома двух групп свиней с разным показателем конверсии корма не выявил достоверных различий на уровне типа, семейства и вида. Результаты демонстрируют необходимость дальнейшего детального изучения данного вопроса.