Распространенность генов антибиотикорезистентности бактерий у свиней в период откорма (sus scrofa domesticus)

Abstract

Целью исследования стал анализ кишечного микробиома свиней в период откорма, направленный на выявление генов антибиотикорезистентности. Высокопроизводительное секвенирование позволило суммарно получить 119 636 прочтений, биоинформатическое исследование которых выявило 17 генов антибиотикорезистентности, принадлежащих к 4 классам антибиотиков: тетрациклины (81%), бета-лактамные антибиотики (11%), эритромицины (7%) и аминогликозиды (1%). Среди 5 обнаруженных генов устойчивости к тетрациклину доминировал ген Tet(W), чье процентное соотношение составляло 73% от числа всех генов антибиотикорезистентности тетрациклиновой группы. Гены устойчивости к эритромицину включали ErmB, ErmG и ErmF с преобладающим большинством последнего (88%). Среди генов резистентности к бета-лактамным антибиотикам были выявлены cfxA4 (18%), cfxA5 (10%), cfxA6 (42%) и ACI1 (30%). Было установлено наличие генов резистентности к аминогликозидам – Aph3-III, Ant6-Ia, Ant6-Ib, Sat4A и AadA1-pm. Наибольшую распространенность получили гены Aph3-III (58%), а наименьшую – AadA1-pm (3%). Результаты проведенного исследования свидетельствуют о широком присутствии генов антибиотикорезистентности в кишечном микробиоме свиней. Распространение этих генов может нести угрозу в будущем не только для сельского хозяйства, но и для здравоохранения.