Анализ генов антибиотикорезистентности Escherichia coli из кишечника поросят с диареей

Abstract

Работа посвящена анализу распространенности генов антибиотикорезистентности в культурах E. coli, изолированных из кишечника поросят с диареей. С использованием высокопроизводительного секвенирования удалось выявить 26 генов антибиотикорезистентности. Они относились к 7 группам антибиотиков: аминогликозиды, бета-лактамные антибиотики, хинолы, сульфонамиды, тетрациклины, диаминопиримидины, фениколы. Относительная обильность гена QnrD была максимальная в исследуемой выборке изолятов E. coli (50%). Для остальных последовательностей генов антибиотикорезистентности процентное соотношение каждой отдельной группы генов не превышало 10%. Наибольшее количество разновидностей генов было характерно для класса генов резистентности к бета-лактамным антибиотикам (AmpC1_Ecoli, OXA-10, OXA-14, OXA-16, Penicillin_Binding_Protein_Ecoli, TEM-143, TEM-166, TEM-215 и TEM-76, TEM-95).